לשלומי שלום,
הפרעון החלקי של הקרן והריבית הם אכן באחוזים ביחס למחיר "המלא" של האג"ח, כלומר לפי הערך המתואם ולא לפי המחיר שהאג"ח נסחר כעת בשוק.

העדכון מבוצע כך:
לגבי הריבית: ביום האקס מחיר האג"ח יורד בגודל תשלום הריבית.
לגבי הקרן: כמות האג"חים יורדת לפי הכמות ששולמה, כלומר: כמות האג"חים הנותרת בשוק קטנה (מה שנקרא היקף הסידרה).

מקווה שעניתי לשאלתך.